Theo đó, tại tuyến huyện sẽ thực hiện sáp nhập bệnh viện huyện với trung tâm y tế thành Trung tâm y tế huyện. Tại tuyến tỉnh sẽ thực hiện mô hình Trung tâm Kiểm soát bệnh tật trên cơ sở sáp nhập các trung tâm có cùng chức năng về quản lý Y tế dự phòng như Trung tâm Y tế dự phòng, Trung tâm phòng chống HIV/AIDS, Trung tâm chăm sóc sức khỏe sinh sản,... 

Khi thành lập trung tâm kiểm soát bệnh tật ở tuyến tỉnh, cả nước sẽ dôi dư khoảng 1.260 giám đốc và phó giám đốc các trung tâm, đơn vị, chưa kể cán bộ cấp trưởng phòng, phó phòng. Ở cấp huyện sẽ dôi dư khoảng 2.000 cán bộ lãnh đạo.

Tại Thái Bình, ngành y tế tỉnh đề xuất giữ nguyên mô hình bệnh viện huyện và trung tâm y tế tuyến huyện tách rời. Còn Trung tâm kiểm soát bệnh tật tuyến tỉnh đang được xây dựng kế hoạch để triển khai thực hiện.