Trường Đại học Y Dược Thái Bình nâng cao hiệu quả giáo dục bằng cách tăng cường kết hợp nghiên cứu khoa học với hoạt động dạy và học của nhà trường.
Đề tài "Nghiên cứu phẫu thuật nội soi vá nhĩ bằng kỹ thuật đặt mảnh ghép trên - dưới lớp sợi" đã đạt giải Ba trong Hội thi Sáng tạo Kỹ thuật toàn quốc lĩnh vực y dược năm 2015-2016 của nhóm tác giả trường Đại học Y Dược Thái Bình.
Trường chú trọng công tác nghiên cứu khoa học tuổi trẻ, triển khai đến tận các bộ môn và các lớp sinh viên. Hoạt động của Câu lạc bộ (CLB) sinh viên nghiên cứu khoa học được củng cố và phát triển.
Trong năm 2016, hơn 200 thành viên CLB được học tập phương pháp nghiên cứu khoa học. Trường cũng tích cực gắn liền nghiên cứu khoa học với đào tạo cán bộ sau đại học, chủ động tổ chức các hội nghị hợp tác khoa học công nhệ và đào tạo sau đại học giữa trường Đại học Y dược Thái Bình với các trường đại học và các bệnh viện đầu ngành.
Đến nay, nhà trường đã hoàn thành trên 1.300 đề tài nghiên cứu khoa học, trong đó, nhiều đề tài do sinh viên nhà trường nghiên cứu và đưa vào ứng dụng.