Hầu hết các bệnh viện có cán bộ được đào tạo chuyên ngành xét nghiệm chung nhưng chưa có cán bộ được đào tạo chuyên sâu về từng lĩnh vực sinh hóa, huyết học, vi sinh, miễn dịch. Sổ ghi chép vận hành trang thiết bị, nhật ký ghi chép mẫu thực hiện chưa đầy đủ, chưa có hình thức phản hồi thông tin liên quan đến xét nghiệm với các khoa lâm sàng.

Hoạt động nội kiểm chưa thực sự nghiêm túc. Hoạt động ngoại kiểm chưa được quan tâm ở một số bệnh viện. Chưa có nhân viên chuyên trách được đào tạo về quản lý chất lượng xét nghiệm. Việc ghi chép khi phát hiện có sai lệch kết quả xét nghiệm và có biện pháp xử lý khắc phục chưa được đảm bảo. Một số bệnh viện được đánh giá không cao là BV Y học cổ truyền, BV Mắt Thái Bình...